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基因芯片技術(shù)服務(wù)
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基因芯片技術(shù)服務(wù) |
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基因芯片技術(shù)服務(wù)
主要功能
1. 基因芯片技術(shù)服務(wù)能夠完成小鼠和人類基因表達(dá)譜芯片的優(yōu)化和批量制作。
2. 通過對(duì)基因芯片數(shù)據(jù)處理和分析，可對(duì)芯片數(shù)據(jù)進(jìn)行倍值，統(tǒng)計(jì)，聚類，分子網(wǎng)絡(luò)等系列分析。
3. 通過設(shè)計(jì)TaqMan探針和引物可提供對(duì)芯片結(jié)果的定量實(shí)時(shí)PCR(TaqMan)驗(yàn)證支持。
4. 提供對(duì)小鼠和人類表達(dá)譜芯片所有基因的生物信息學(xué)自動(dòng)注釋及更新。
實(shí)驗(yàn)儀器
1. OmniGrid100 Microarrayer
主要特點(diǎn)與技術(shù)參數(shù)
· 高速可靠的馬達(dá)和和移動(dòng)平臺(tái)精確性:兩次重復(fù)<+-2.5um
· 步進(jìn)精度：2.5um(X軸和Y軸):1.25um(Z軸)
· 配的是Telechem針,點(diǎn)的平均大小約150um
· 一次最多可放置100塊標(biāo)準(zhǔn)玻片，每片現(xiàn)在最多可點(diǎn)22000個(gè)點(diǎn)
2. Genepix4000B Scanner(Axon)
主要特點(diǎn)與技術(shù)參數(shù)
· 是基于PMT(photomultiplier tube, 光電倍增管)的檢測系統(tǒng)的激光共聚焦原理。
· 可以選擇同步或是連續(xù)掃描，同步掃描可以避免由于機(jī)械原因造成的玻片的定位不準(zhǔn)確，掃描誤差的出現(xiàn)。
· 為單玻片手動(dòng)載入，具有635nm(紅色的)和532nm(綠色的)兩色激光以及適配的紅色和綠色的發(fā)射濾光片。
· 它可掃描多種材料，掃描大小為25mm×75mm。
· 激光強(qiáng)度由5-100%連續(xù)可調(diào)。
· 掃描精度可從5μm-10μm分級(jí)調(diào)整
人和小鼠的cDNA表達(dá)譜芯片基本分類信息
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人的cDNA表達(dá)譜芯片基本分類信息 |
小鼠的cDNA表達(dá)譜芯片基本分類信息 |
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Biological Process |
gene number |
Biological Process |
gene number |
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Amino acid metabolism |
44 |
Cell juction protein |
23 |
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Apoptosis |
237 |
Chaperone |
17 |
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Carbohydrate metabolism |
132 |
Cytoskeletal protein |
37 |
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Cell adhesion |
274 |
Extracellular matrix |
20 |
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Cell cycle |
425 |
Hydrolase |
460 |
|
Cell proliferation and differentiation |
283 |
Ion channel |
62 |
|
Cell structure and motility |
79 |
Isomerase |
52 |
|
Coenzyme and prosthetic group metabolism |
3 |
Kinase |
421 |
|
Developmental processes |
750 |
Lyase |
68 |
|
Electron transport |
200 |
Nucleic acid binding |
444 |
|
Homeostasis |
44 |
Oxidoreductase |
334 |
|
Intracellular protein traffic |
62 |
Phosphatase |
32 |
|
Lipid, fatty acid and steroid metabolism |
183 |
Protease |
8 |
|
Muscle contraction |
68 |
Receptor |
447 |
|
Neuronal activities |
62 |
Signaling molecule |
156 |
|
Nucleoside, nucleotide and nucleic acid metabolism |
246 |
Synthase and synthetase |
51 |
|
Phosphate metabolism |
25 |
Transcription factor |
307 |
|
Protein metabolism and modification |
227 |
Transferase |
496 |
|
Protein targeting and localization |
18 |
Transporter |
231 |
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Signal transduction |
1065 |
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Transport |
1019 |
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服務(wù)內(nèi)容
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服務(wù)名稱 |
服務(wù)內(nèi)容 |
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定制芯片 |
根據(jù)顧客需要設(shè)計(jì)和制備cDNA芯片 |
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芯片實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì) |
為顧客設(shè)計(jì)優(yōu)化芯片實(shí)驗(yàn)以利于得到可靠的數(shù)據(jù)和成果發(fā)表 |
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RNA樣品制備 |
從細(xì)胞或組織中提取RNA樣品 |
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樣本標(biāo)記和雜交 |
1. RNA→cDNA→cRNA,單熒光標(biāo)記，與Codelink或Affymetrix oligo芯片雜交
2. RNA→cDNA，Cy3與Cy5標(biāo)記，與cDNA芯片雜交 |
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芯片簡單數(shù)據(jù)處理 |
1. 芯片所含基因的GeneBank號(hào)、基因名稱與功能簡單描述
2. 芯片實(shí)驗(yàn)檢測得到的信號(hào)值
3. 數(shù)據(jù)分析后的信號(hào)比值，排序，篩選表達(dá)顯著性改變的基因
4. 芯片熒光信號(hào)彩色圖譜一張 |
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芯片數(shù)據(jù)系列分析 |
統(tǒng)計(jì)分析，聚類分析(Hierarchical Clustering)，組圖分析(Self_Organizing Maps, SOMs)，分子網(wǎng)絡(luò)(pathway analysis) |
芯片技術(shù)服務(wù)內(nèi)容說明
1. 費(fèi)用：對(duì)于材料費(fèi)(芯片費(fèi)用)我們將給予優(yōu)惠的價(jià)格；由于我們與Codelink和Affymetrix公司有著很好的戰(zhàn)略伙伴關(guān)系，我們?cè)敢馊f(xié)助廣大的科研人員并以最優(yōu)惠的價(jià)格提供服務(wù)。詳細(xì)服務(wù)價(jià)格敬請(qǐng)來電查詢。(也可以自行提供.)
2. RNA樣本要求：a) cDNA芯片，每張芯片需提供30µg-60µg total RNA。b) Codelink或Affymetrix的寡核苷酸芯片，每張芯片需提供5ug-15µg total RNA。
3. 時(shí)間：服務(wù)所需時(shí)間依樣本情況而定，一般情況下，當(dāng)我們收到您所提供的達(dá)到要求的樣本后2周后即可交付結(jié)果。
服務(wù)價(jià)格
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服務(wù)內(nèi)容 |
服務(wù)收費(fèi) |
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芯片制作 |
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開機(jī)費(fèi) |
2500元（6小時(shí)內(nèi)），每小時(shí)加收250元 |
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玻璃片 |
150元/張 |
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384-well plate |
250元/plate |
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點(diǎn)樣 |
4元/點(diǎn) |
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樣品固定 |
180元/次 |
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轉(zhuǎn)移樣品 |
600元/384-well |
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芯片點(diǎn)樣位置設(shè)計(jì) |
1000點(diǎn) 350元/次 |
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1001-5000點(diǎn)，550元/次 |
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5000點(diǎn)，850元/次 |
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核酸提取及熒光標(biāo)記 |
視具體實(shí)驗(yàn)內(nèi)容收費(fèi) |
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雜交反應(yīng) |
視具體實(shí)驗(yàn)內(nèi)容收費(fèi) |
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Axon Scanner圖象掃描 |
600元/張芯片 |
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Genepix定量分析 |
1000點(diǎn)，550元/張芯片 |
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1001-5000點(diǎn)，850元/張芯片 |
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5000點(diǎn)，1200元/張芯片 |
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基因表達(dá)的Real-time RT-PCR驗(yàn)證 |
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引物設(shè)計(jì)、RNA逆轉(zhuǎn)錄、Real-time RT-PCR及數(shù)據(jù)分析 |
視具體實(shí)驗(yàn)內(nèi)容收費(fèi) |
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基因芯片數(shù)據(jù)分析 |
數(shù)據(jù)質(zhì)量評(píng)估 |
￥180/張 |
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基本數(shù)據(jù)分析（雜交信號(hào)值、基因注釋、信號(hào)比值、差異表達(dá)基因的篩選） |
前兩張：￥3500/張，
多于兩張則以后￥600/張 |
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高級(jí)數(shù)據(jù)分析服務(wù)（基本數(shù)據(jù)分析、統(tǒng)計(jì)分析、篩選差異表達(dá)基因、表達(dá)模式識(shí)別、功能富集分析、文獻(xiàn)挖掘等） |
￥6000/張 | |
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中文(China)
英文(English)
